تميز كردن صندلي غذاي كودك نيز مانند ساير وسايل او نياز به توجه خاص داشته و بايد آن را به‌طور مرتب ضدعفوني كرد. به‌طور طبيعي پس از هر بار غذا خوردن كودك بايد سيني صندلي را با دستمال تميز كرد اما تميز كردن ساير اجزاي صندلي هر چند هفته يكبار و در صورت بيمار بودن كودك هفته‌اي يكبار ضروري است.
بدين منظور بايد اجزاي صندلي را تا حد امكان از هم جدا كرد. سپس صندلي را روي روزنامه و يا درون حمام قرار داد تا بقاياي غذا و قطرات آب و صابون روي زمين نچكد.
يك سطل را از آب پر كرده و مقداري صابون ملايم درون آن ريخت. سطل ديگري را نيز از آب گرم براي شست‌وشو پر كرد. در صورت امكان بهتر است از مواد شوينده مخصوص كودك استفاده شود.
ابتدا بايد صندلي را با جاروبرقي تميز كرد تا ذرات باقيمانده غذا از روي آن جمع شود. سپس به ترتيب سيني، قسمت پشت و جلو صندلي، دسته‌ها و سپس پايه‌هاي آن را با محلول آب و صابون شست‌وشو داده و تميز كرد. پس از آن نيز كل صندلي را يك يا دو بار آبكشي كرد تا صندلي كاملاً شسته شود. براي تميز كردن گوشه‌ها نيز بايد از گوش پاك‌كن استفاده شود.
قسمت پارچه‌اي صندلي و كمربند ايمني را نيز بايد كاملاً شست‌وشو داد. سپس اجازه داد تا براي مدت حداقل 30 تا 60 ثانيه خشك شود و يا اينكه صندلي را با دستمال حوله‌اي تميز خشك كرد.
براي ضدعفوني كردن صندلي نيز بايد از مخلوط سركه و آب استفاده شود.